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La metatranscriptomique révèle les communautés microbiennes fibrolytiques du rumen

Par S. Comtet-Marre, N. Parisot, P. Lepercq, F. Chaucheyras-Durand, P. Mosoni, E. Peyretaillade, A. R. Bayat, K. J. Shingfield, P. Peyret, E.Forano

Publié le 31/01/2017

Titre de l’étude : «Metatranscriptomics Reveals the Active Bacterial and Eukaryotic Fibrolytic Communities in the Rumen of Dairy Cow Fed a Mixed Diet»

 

Etude métatranscriptomique du microbioteGlossaryView allMicrobioteGlossaryView allMicrobioteGlossaireView allMicrobiote
Un microbiote est l’ensemble de l’écosystème (bactéries, levures, champignons et virus) vivant dans un environnement spécifique. Le microbiote intestinal était auparavant appelé « flore intestinale »

Un microbiote est l’ensemble de l’écosystème (bactéries, levures, champignons et virus) vivant dans un environnement spécifique. Le microbiote intestinal était auparavant appelé « flore intestinale »

Un microbiote est l’ensemble de l’écosystème (bactéries, levures, champignons et virus) vivant dans un environnement spécifique. Le microbiote intestinal était auparavant appelé « flore intestinale »
du rumen des vaches laitières qui examine à la fois l’expression de gènes codant pour des enzymes dégradant les fibres (enzymes actives des glucides, ou CAZymes) et les populations microbiennes. Cette étude révèle que l’importance de la contribution des champignons et des protozoaires ciliés à la dégradation des polysaccharidesGlossaryView allPolysaccharidesGlossaryView allPolysaccharidesGlossaryView allPolysaccharidesGlossaryView allPolysaccharidesGlossaireView allPolysaccharides
Succession de plusieurs molécules de sucres.

Succession of several sugars molecules.

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était sous-estimée jusqu’à présent. Elle confirme également le rôle central des espèces bactériennes fibrolytiquesGlossaryView allFibrolytiquesGlossaryView allFibrolytiquesGlossaireView allFibrolytiques
Ayant la capacité d’hydrolyser des fibres.

Ayant la capacité d’hydrolyser des fibres.

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précédemment caractérisées Prevotella, Ruminocccus et Fibrobacter. L’étude identifie 12 237 CAZymes, soit 1% des transcriptions d’ARN totales.

 

Lire la publication en anglais